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在上一季中以果敢干練的作風和高超驚人的醫術人稱 “Doctor X”外科醫生大門未知子（米倉涼子 飾）在早已形同腐臭泥潭一般的帝都醫科大學第三醫院力挽狂瀾掀起前所未有的風暴因在北海道馬場冒險為一匹骨折的馬做手術未知子得到內科專家馬淵一代（三田佳子 飾）的賞識進而受邀踏入全日本頂尖醫者云集的殿堂——帝都醫科大學附屬醫院此前不久外科總負責人蛭間重盛（西田敏行 飾）曾親手為醫院的大金主——某地產大鱷二宮欽也（寺田農 飾）完成高危手術誰知此番二宮癌癥復發再度入院第二外科主任海老名（遠藤憲一 飾）攜團隊積極備戰配合蛭間迎接新一輪的手術而馬淵所率領的內科則就治療方式上與外科產生嚴重分歧和對立 　　未知子的到來無疑使雙方的矛盾趨于白熱化……